Les FOS sont des fructo-oligosaccharides, appelés également bifidofibres. Elles sont composées d’une molécule de saccharose associée à une ou plusieurs molécules de fructose. Les FOS à chaîne courte sont obtenues à partir de saccharose auquel on greffe une, deux ou trois unités fructose. Les FOS à chaîne longue sont obtenues par hydrolyse de l’inuline, grâce à une enzyme nommée endo-inulinase. La structure particulière des FOS les rend peu digestibles dans l’intestin grêle. Ces fibres se comportent en effet comme des fibres solubles et se retrouvent ainsi dans le colon où elles sont utilisées comme substrat par les bactéries de la flore colique, les bifidobactéries. Des études ont montré que cet effet appelé « bifidogène » était associé chez l’homme à l’amélioration du transit intestinal, à la stimulation du système immunitaire et à une action antidiarrhéique. Chez l’animal, le rôle des bifidobactéries dans la prévention du cancer du colon a aussi été suggéré. A noter que cet effet bifidogène est reconnu à partir d’une dose de 5 g de FOS/jour (allégation reconnue par la DGCCRF depuis 1997).